'www'をつけないドメイン名も使えるか？

はい、使えます。
独自ドメインサービスでは、URL中のサーバ名の先頭に'www'をつけてもつけなくても同様にページが表示されます。

自作のCGIを使えるか？

自作のCGIを含む各種のCGIをご利用頂けます。

CGIに関して設置可能ディレクトリ等の制限はあるのか？

CGIには設置可能ディレクトリ等の制限はございません（どのディレクトリにも配置可能です）。

利用可能なプログラム言語は？

PHPやShellスクリプトなどをご利用可能です。

sendmailは使えるか？

はい、利用可能です。

.htaccessや.htpasswdは使えるか？

はい、利用可能です。